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Amber
タンパク、生体分子用の MM、MD 計算プログラムです。分極率の項を力場に取り入れたフリー・エネルギー計算モジュールや動力学と NMR とのフィッティング・プログラムなどが拡張されています。arm96 や OPLS などの構造データベースをもち、溶媒水分子の配置などのビルダーモジュールも多数用意されています。独自に有用性の高いパラメータを持つ他、ダイナミックス計算の解析ツールでトラジェクトリ解析、NMR のリファインメント等が可能です。
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